本文只讨论使用RSA算法的x509证书。本文在撰写时使用特定版本的openssl，但大部分情况下也应该适用于其它版本。
$ openssl version
OpenSSL 1.1.0f 25 May 2017
1 生成
生成自签名证书可分为使用基本步骤和快捷步骤。快捷步骤只是通过特殊选项合并基本步骤中的一步或两步。通过openssl生成的文件默认都是PEM格式，可直接用于apache或nginx。如使用IIS需要在生成后转换为pfx格式。
1.1 基本步骤
生成自签名证书的基本步骤如下：
– 生成私钥(Private Key)文件
– 生成证书(签名)请求文件CSR，需要使用私钥
– 生成自签名证书(Certificate)文件，需要使用证书请求文件
1.1.1 步骤1 生成RSA私钥(Private Key)
RSA私钥中也包含公钥。命令为openssl genrsa，格式：
openssl genrsa [<options>] <bit-length>
[-des3 | -aes128 | ...] #指定用于保护私钥的对称加密算法
[-passout pass:<password> | -passout file:<path-name> | -passout env:<variable> | -passout fd:<file-descriptor> | -passout stdin] #指定输出私钥的加密密码来源
-out <private-key-file> #输出私钥到文件，不指定则输出到stdout
举例，生成一个长度为2048位的RSA私钥（含公钥）：
openssl genrsa -out ca.key 2048
举例，生成一个长度为2048位，并用aes128加密的私钥，密码为1234：
openssl genrsa -aes128 -passout pass:1234 -out ca-pass.key
1.1.2 步骤2 用私钥生成证书签名请求(Certificate Signing Request, CSR)
命令为openssl req，格式：
openssl req
-new #生成新的证书签名请求
-key <private-key> #在步骤1中生成的私钥
[-passin pass:<password> | -passin file:<path-name> | -passin env:<variable> | -passin fd:<file-descriptor> | -passin stdin] #指定所用私钥的密码
-subj '/C=<country>/ST=<province>/L=<locality>/O=<organiation>/OU=<organiation-unit>/CN=<common-name>/emailAddress=<email>'
-out <csr-file> #输出证书请求到文件，不指定则输出到stdout
选项-subj指定证书所有人主体信息，如果证书用于网站，则其中的CN域必须指定为网站域名，其他域不是必填项。
举例，为www.mysite.com生成证书签名请求：
openssl req -new -key ca.key -subj '/C=CN/ST=ZheJiang/L=HangZhou/O=CompanyName/OU=DepartmentName/CN=www.mysite.com' -out mysite.csr
举例，为www.mysite.com生成证书签名请求，同时指定之前生成私钥时所用密码：
openssl req -new -key ca-pass.key -passin pass:1234 -subj '/C=CN/ST=ZheJiang/L=HangZhou/O=CompanyName/OU=DepartmentName/CN=www.mysite.com' -out mysite.csr
1.1.3 步骤3 生成自签名证书
步骤3有两种命令可以实现，分别是openssl req -x509和openssl x509 -req。有一点小区别是前者使用-key指定私钥，后者用-signkey指定私钥。
步骤3方法1 openssl req -x509
命令openssl req格式
openssl req
-x509 #生成自签名证书，而不是证书请求
-days <days> #指定证书有效期天数
-md2 | -md5 | -sha1 | -sha256 | -sha512 #签名所用哈希算法
-key <private-key-file>
-in <csr-file>
-out <certificate-file>
举例，为证书请求文件签名并生成证书：
openssl req -x509 -days 365 -sha256 -key ca.key -in mysite.csr -out mysite.crt
步骤3方法2 openssl x509 -req
命令openssl x509格式：
openssl x509
-req #输入内容为证书请求，而不是证书
-days <days> #指定证书有效期天数
-md2 | -md5 | -sha1 | -sha256 | -sha512 #签名所用哈希算法
-signkey <private-key-file>
-in <csr-file>
-out <certificate-file> #输出证书到文件，不指定则输出到stdout
举例，为证书请求文件签名并生成证书：
openssl x509 -req -days 365 -sha256 -signkey ca.key -in mysite.csr -out mysite.crt
此方法似乎不会读取/etc下的openssl.cnf的设置（不同发行版路径不同，使用find /etc/ -name openssl.cnf查找），如果在其中有设置subjectAltName不会起作用。
1.2 快捷步骤
可以合并基本步骤中的一步或两步，来减少命令输入量。快捷步骤总是以基本步骤2（openssl req）为基础，通过增加额外的选项来合并其它步骤。
1.2.1 基本步骤1,2一起做
如果还未生成私钥，可以在基本步骤2的命令openssl req的基础上，用-newkey代替-key，来指明生成证书请求的同时生成私钥。与私钥有关的基本步骤1中的选项便可以同时出现。
-newkey <type:length> #指定私钥类型及长度，如rsa:2048
-keyout <private-key-file>
-nodes #不要为私钥使用对称密钥加密，相当于基本步骤1中不指定加密算法
举例，使用一条命令生成私钥和证书签名请求：
openssl req -new -newkey rsa:2048 -keyout ca.key -passout pass:1234 -subj '/C=CN/ST=ZheJiang/L=HangZhou/O=CompanyName/OU=DepartmentName/CN=www.mysite.com' -out mysite.csr
其中-passout来自于基本步骤1中的选项。
1.2.1 基本步骤2,3一起做
如果已经有了私钥，也可以合并基本步骤2,3，来直接生成证书，而跳过证书请求。在基本步骤2的命令openssl req的基础上，用-x509代替-new：
-x509 #生成自签名证书，而不是证书请求
相当于把基本步骤2（openssl req）和基本步骤3方法1（openssl req -x509）合并起来。
举例，利用已有私钥，通过一条命令来生成自签名证书：
openssl req -new -x509 -key ca.key -subj '/C=CN/ST=ZheJiang/L=HangZhou/O=CompanyName/OU=DepartmentName/CN=www.mysite.com' -days 365 -sha256 -out mysite.crt
1.2.2 基本步骤1,2,3一起做
如果要同时生成私钥和自签名证书，也可以用一条命令完成，只要把合并步骤1,2及合并步骤2,3的选项放在一起便可。
举例，通过一条命令生成私钥和自签名证书
openssl req -x509 -newkey rsa:2048 -keyout ca.key -nodes -subj '/C=CN/ST=ZheJiang/L=HangZhou/O=CompanyName/OU=DepartmentName/CN=www.mysite.com' -days 365 -sha256 -out mysite.crt
2. 利用私钥和现有证书重新生成证书签名请求
可以通过基本步骤1产生的私钥和基本步骤3产生的证书来重新生成证书请求文件，而无须重新指明主体信息。
在使用自签名证书的情形下作用不大，但如果曾经把证书请求提供给第三方进行过签名，那么通过此方法可以快速重新生成证书请求文件，从而再次申请签名。
命令为openssl x509 -x509toreq，格式：
-x509toreq #将x509证书转换为证书请求
-signkey <private-key-file>
-in <certificate-file>
-out <csr-file> #输出证书请求到文件，不指定则输出到stdout
举例，通过私钥和证书，生成证书请求文件：
openssl x509 -x509toreq -signkey ca.key -in mysite.crt -out mysite.csr
3 查看信息
查看信息的共有选项如下，不再单独列出：
-text #解析原始内容，以可理解的方式输出信息
-noout #不输出原始内容
[-passin pass:<password> | -passin file:<path-name> | -passin env:<variable> | -passin fd:<file-descriptor> | -passin stdin]
-in <input-file> #指定输入内容的来源
-out <output-file> #指定输出到文件，不指定则输出到stdout
3.1 查看私钥信息
使用openssl rsa命令，举例：
openssl rsa -text -noout -in ca.key
3.2 查看证书签名请求信息
使用openssl req命令，举例：
openssl req -text -noout -in mysite.csr
3.3 查看证书信息
使用openssl x509命令，举例：
openssl x509 -text -noout -in mysite.crt
4 MinGW/MSYS/git-bash for Windows下生成证书时报错：Subject does not start with ‘/’
解决方案与原因详见：https://stackoverflow.com/questions/31506158/running-openssl-from-a-bash-script-on-windows-subject-does-not-start-with